Посмотрите информацию как бороться вот в этой книге (скачать можно в сети): Иванов Л., Савчук С. 2005 - "Рифовый аквариум", стр. 254.
У Вас молодой аквариум, появление небольшого количества водорослей через некоторое время после запуска - это скорее норма. Причём один тип водорослей, приходит на смену другому. По крайней мере у меня так происходило.