Вообще в целом изучите понятие азотного цикла и нюансов жизни морских обитателей в рамках этого цикла. Если в кратце - то морская живность существенно чувствительнее к перепадам аммиака/нитратов/фосфатов/pH и т.п. Чем прихотливее вы будете брать кораллы/рыб тем чувствительнее они будут к скачкам параметров, тем лучше должна быть очистка. Причем не сколько механическая, сколько химическая и биологическая (это всякие угли антифосы и т.п + большая популяция бактерий, и место для их жизни - пористые камни биошары и т.п). Обычные губки как в персной акве малоэффективны в море, в море в основном пользуют пенник, т.к. степень механической очисти от остатков корма и прочей органики выше, чем у губок. + Еще живности нужен кислород, а он может взятся из разных источников, но довольно эффективных считается водорослевик, там живут растения, похожие на обычный пресник, которые под действием света фонтосинтезируют и выделяют кислород.
Ну как то вот такая очень очень стиснутая матчасть. Так что в руки вам учебники по химии физике и биологии класс за 7-9
Еще чуть чуть добавлю. Вот интересная темка морского аквариума по принципу сделай сам
http://akva.by/forum/index.php?topic=11855.0 Можно даже так