Ваша проблема заключается в том, что перенаселив аквариум вы поставили очень четкие границы изменения параметров. Надо бы снизить ph и уменьшить его колебания путем не отключения CO2 (чтобы минимизировать причину появления водорослей), но при этом кислородный буфер аквариума из-за большого количества рыб явно недостаточен для ночного периода.
Я например давно уже не отключаю CO2 на ноч и ни разу не видел чтобы рыбы плавали у поверхности, заглатывая воздух.