Кто его знает. Но вообще - циано способно на фиксацию азота. Может не все виды. Спирулина кстати - тоже циано.
Получается при нулевом нитрате появляется "житель" занимающий нишу водорослей, но берет азот из воздуха. А отдает уже в воду. В виде органики.
Вроде в факе Сантамоники про циано в скраббере говорят когда там света мало. То есть что-то не так.
Но я думаю причина одна - нитрат - ноль, фосфат есть.
Вроде, опять же, Сантамоника пишет, что фосфаты лучше уходят при росте в скраббере зеленых нитчатых водорослей, а они не растут при нехватке железа. Но у тебя - цементные камни, там этого железа... Хотя может оно потеряло "биодоступность".
Похоже 2 выхода. Добавление нитрата, либо добавление железа.